Gracias a su extensa formación en ciencias básicas y su enfoque hacia la innovación, las y los Bioingenieros de la FCB pueden cumplir funciones de investigación y de creación de aplicaciones en el área de las ciencias biológicas.
El campo ocupacional está en centros de biotecnología, institutos de investigación, centros y empresas productivas, instituciones relacionadas a la conservación y preservación de la biodiversidad, además de docencia e investigación en Instituciones de Educación Superior.
En el sector industrial, las y los bioingenieros actúan como nexo entre el proceso biológico y el industrial; en universidades y centros de educación superior, participará en las actividades académicas de estos establecimientos; en organizaciones públicas o privadas, dedicados al estudio del medio ambiente en áreas de desempeño tales como biorremediación, bioseguridad, así como en acuicultura, plantas transgénicas, ingeniería genética, uso de organismos genéticamente modificados, producción de biopolímeros, manejo y optimización de biorreactores o procesamiento de biomateriales.