Profesor Asociado
faguilera@udec.cl
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Edificio Biología Molecular, 1er Piso. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular
Biólogo marino de la Universidad de Valparaíso con estudios de doctorado en la Universidad de Queensland (Australia). Realiza una estancia postdoctoral en Australia para luego ir al Centro Sars de la Universidad de Bergen en Noruega a realizar su segunda estancia postdoctoral. En el 2017, se adjudica un concurso PAI Inserción en la Academia de Conicyt, y en el 2018 se integra al Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de Concepción para realizar investigación y docencia de pregrado y postgrado en las áreas de ciencias ómicas, bioinformática, y evolución.
1. Genómica funcional y evolución de la biomineralización.
2. Genómica del desarrollo y evolución de los tipos células.
3. Evolución de genomas y adaptación de los animales.
4. Ecología microbiana y relaciones simbióticas eucarionte, microorganismos.
PAI 79170033: Genómica comparativa y funcional aplicada al estudio y la evolución de la biomineralización en animales (2018-2021; Investigador Principal).
FONDECYT 11180084: Cellular, transcriptional, and regulatory characterization of shell formation in the Pacific oyster (Crassostrea gigas) under ocean acidification conditions (2018-2021; Investigador Principal).
FONDEF ID18I10192: Bases para el desarrollo de una herramienta biotecnológica para mejorar la eficiencia en procesos de puesta en marcha y operación de biofiltros en sistemas de recirculación acuícola (2018-2020; Co-Investigador).
FONDECYT 1190926: A Sox2/Sox9/FoxL1 transcriptional code drives developmental and regenerative skull ossification (2019-2022; Co-Investigador).
LIA-MAST (International Associated Laboratory-Multiscale Adaptive STrategies). Creación de un Laboratorio Internacional Chile-Francia. Working groups: Evolutionary developmental biology and cellular processes, and Emergent biological tools (2019-2023; Investigador Asociado, UdeC).
VRID Multidisciplinario (Proyecto N°: 220.031.117-M): “Combination of zebrafish and mouse models to study Mgat1-dependent protein N-glycosylation regulating cortical granule biology and egg activation”. (Abril 2020-Marzo 2022). Posición: Co-Investigador.
FONDEF IDeA 2019 (Proyecto N°: ID19I10382): “Desarrollo y validación de un producto biológico para controlar preventivamente la Marchitez Bacteriana y Pudrición Parda en el cultivo de la papa (Solanum tuberosum). (Enero 2020-Diciembre 2022). Posición: Investigador Asociado.
1. Ruiz P, Sepúlveda D, Torres C, Vidal JM, Villouta G, Carrasco C, Aguilera F, Ruiz-Tagle N, Urrutia H. 2019. Overview and future prespectives of nitryfing bacteria on biofilters for recirculating aquaculture systems. Reviews in Aquaculture doi:10.1111/raq.12392.
2. Fromm B, Tosar JP, Aguilera F, Friedländer MR, Bachmann L, Hejnol A. 2019. Evolutionary implications of the first microRNA- and piRNA complement of Lepidodermella squamata (Gastrotricha). Non-Coding RNA 5:19. doi:10.3390/ncrna5010019.
3. Thiel D, Franz-Wachtel M, Aguilera F, Hejnol A. 2018. Xenacoelomorph neuropeptidomes reveal a major expansion of neuropeptide systems during early bilaterian evolution. Molecular Biology and Evolution 35:2528-2543. doi: 10.1093/molbev/msy160.
4. Fernandez-Valverde SL*, Aguilera F*, Ramoz-Diaz RA. 2018. Inference of developmental gene regulatory networks beyond classical model systems: new approaches in the post-genomic era. Integrative and Comparative Biology 58:640-653. doi: 10.1093/icb/icy061. *Autores de correspondencia.
5. Aguilera F*. 2017. Neoplasia in mollusks: what does it tell us about cancer in humans? A review. Journal of Genetic Disorders 1:07. *Autor de correspondencia.
6. Lim DKY, Schuhmann H, Thomas-Hall SR, Chan KCK, Wass JT, Aguilera F, Adarme-Vega CT, Dal’Molin CGO, Thorpe GJ, Batley J, Edwards D, Schenk PM. 2017. RNA-Seq and metabolic flux analysis of Tetraselmis sp. M8 during nitrogen starvation reveals a two-stage lipid accumulation mechanism. Bioresource Technology 244:1281-1293. doi: 10.1016/j.biortech.2017.06.003.
7. Aguilera F, McDougall C, Degnan BM. 2017. Co-option and de novo gene evolution underlie molluscan shell diversity. Molecular Biology and Evolution 34:779-792. doi: 10.1093/molbev/msw294.
8. Kocot KM*, Aguilera F*, McDougall C, Jackson DJ, Degnan BM. 2016. Sea shell diversity and rapidly evolving secretomes: insights into the evolution of biomineralization. Frontiers in Zoology 13:23. doi: 10.1186/s12983-016-0155-z. *Estos autores contribuyeron igualmente al trabajo.
9. Aguilera F, McDougall C, Degnan BM. 2014. Evolution of the tyrosinase gene family in bivalve molluscs: independent expansion of the mantle gene repertoire. Acta Biomateralia 10:3855-3865. doi: 10.1016/j.actbio.2014.03.031.
10. McDougall C, Aguilera F, Moase P, Lucas JS & Degnan BM. (2013). Pearls. Current Biology 23:R671-R673 (doi: 10.1016/j.cub.2013.05.042).
11. Aguilera F, McDougall C & Degnan BM. (2013). Origin, evolution and classification of type-3 copper proteins: lineage-specific gene expansions and losses across the Metazoa. BMC Evolutionary Biology 13:96 (doi: 10.1186/1471-2148-13-96). (Highly accessed)
12. McDougall C, Aguilera F & Degnan BM. (2013). Rapid evolution of pearl oyster proteins with repetitive, low-complexity
domains. Journal of the Royal Society Interface 10:20130041 (doi: 10.1098/rsif.2013.0041). (Cover image)
13. Aguilera F, Lafarga-De la Cruz F & Gallardo-Escarate C. (2009). Molecular analysis in Chilean commercial gastropods based on DNA sequences of 16S rRNA, COI and ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequences. Gayana 73:17-27 (doi: 10.4067/S0717 -65382009000100003).
14. Aguilera F, Valenzuela-Muñoz V & Gallardo-Escarate C. (2008). Authentication of commercial Chilean molluscs using ribosomal internal transcribed spacer (ITS) as species-specific DNA marker. Gayana 72:186-195 (doi: 10.4067/S0717 -65382008000200007).
15. González G*, Aguilera F* & D’Afonseca V. (2020). Transcriptome profiling of raspberry (Rubus idaeus Var. Amira) in response to infection by tomato ringspot virus (ToRSV). Heliyon 6:e04518. *Estos autores contribuyeron igualmente al trabajo.
16. Ruiz P, Sepúlveda D, Torres C, Vidal JM, Villouta G, Carrasco C, Aguilera F, Ruiz-Tagle N & Urrutia H. (2020). Overview and future perspectives of nitrifying bacteria on biofilters for recirculating aquaculture systems. Reviews in Aquaculture 12:1478-1494 (doi:10.1111/raq.12392).
Laboratorio de Genómica Marina, Desarrollo y Evolución.
Sello de excelencia propuesta 746953, EVODEVOGRN “Comparative regulatory genomics of xenacoelomorph mesoderm development and evolution of developmental gene regulatory networks” por parte de Horizon 2020’s Marie Sklodowska-Curie actions call H2020-MSCA-IF-2016.
Comité Editorial de Revistas Científicas
2021 – hasta la fecha Editorial Board: Biochemical Genetics – https://www.springer.com/
2022 – hasta la fecha Editorial Board: Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution – https://onlinelibrary.wiley.
2022 – hasta la fecha eLife Early Career Reviewer – https://lookerstudio.google.
2022 – hasta la fecha Topic Editor Frontiers in Marine Science: Spiralian Genomics in a Changing World – https://www.frontiersin.org/
Comité de Sociedades Científicas
2022 – hasta la fecha Presidente Electo de la International Society for Invertebrate Morphology (ISIM) – https://icim5-2022.univie.
2022 – hasta la fecha Board Member: International Marine Biotechnology Association (IMBA) – http://theimba.org/imba-
2023 – hasta la fecha Delegado del Directorio de la Sociedad Chilena de Evolución (SOCEVOL) – https://www.socevol.cl/
2023 – hasta la fecha Delegado de la Sección de Genómica y Bioinformática de la Sociedad Chilena de Genética (SOCHIGEN) – https://sochigen.cl/
Evaluador de Programas de Postgrado y Proyectos Científicos
2023 – hasta la fecha Evaluador de Proyectos Fondecyt Regular, Grupo de Estudio Biología 3 – ANID (Chile)
2022 – hasta la fecha Evaluador de Proyectos de Exploración – ANID (Chile)
2022 – hasta la fecha Evaluador Proyectos de Investigación Científica de la Universidad de la República (Uruguay)
2022- hasta la fecha Evaluador de la Comisión de Acreditación (CNA) – Chile, Área Programas de Postgrado
