La iniciativa, que será impulsada por la FCB y la Universidad de Viena, surge tras la visita del Doctor del Departamento de Zoología Integrativa de la casa de estudios austríaca, Andrew Calcino, quien llegó hasta la FCB para realizar una exposición orientada a alumnos de pre y post grado.
Enfatizando en la importancia de aplicar enfoques de biología de sistemas a modelos animales emergentes con el objeto de mejorar la comprensión de los mecanismos moleculares que regulan el desarrollo embrionario, en este caso ejemplificando con el caso del molusco Dreissena rostriformis de quagga; se desarrolló la exposición del Doctor Andrew Calcino, destacado investigador del Departamento de Zoología Integrativa de la Universidad de Viena (Austria), quien visito la Facultad de Ciencias Biológicas.El académico realizó una exposición orientada a alumnos de pre y postgrado de la UdeC, la cual tituló “Core promoter analysis and developmental co-expressed gene network analysis in the bivalve quagga mussel Dreissena rostriformis”.
En la exposición el Doctor Calcino presentó su trabajo en torno a la caracterización de secuencias promotoras en el genoma de Dreissena rostriformis y cómo estas estarían controlando la expresión génica durante el desarrollo embrionario de esta especie. Además, entregó detalles sobre la forma en que el uso de análisis de redes de co-expresión de genes (basados en el algoritmo Weighted Gene Co-Expressed Network Analysis, WGCNA en Ingles) permiten la identificación de módulos de genes co-expresados, cuyos perfiles de expresión describen los diferentes procesos que ocurren durante el desarrollo embrionario de Dreissena rostriformis.
El investigador australiano destacó que “es impresionante estar acá, hay muchos proyectos que se están haciendo en las mejores áreas. Una de las cosas que me gustaría lograr mientras estoy aquí es poder entrenarme y colaborar en futuros proyectos relacionados con evolución y desarrollo, también en genómica y todos los temas vinculados a la investigación que Felipe (Aguilera) realiza”. Aseguró que “la intención es poder lograr la mayor cantidad de colaboraciones posibles y aprovechar esta oportunidad para poder llevar a cabo todo tipo de actividades científicas”.
El trabajo de este académico ha destacado por sus estudios en torno a la micromorfología, la neurobiología y la biología evolutiva de invertebrados marinos, específicamente en “Mollusc-omics”, línea de investigación que busca reconstruir de manera holística la historia evolutiva de moluscos, para lo cual ha secuenciado el genoma de Dreissena rostriformis.
Además, el investigador está desarrollando proyectos de secuenciación de transcriptomas de células individuales en diferentes etapas del desarrollo embrionario de Dreissena rostriformis y está implementando herramientas de edición del genoma del tipo CRISPR/Cas9.Respecto a su impresión del desarrollo científico en la UdeC, Calcino comentó que “creo que están haciendo un gran progreso. Creo que la calidad de las preguntas que me hicieron después de mi exposición demuestra que el público chileno tiene un nivel bastante bueno”.
La Decana de la FCB, Dra. Soraya Gutiérrez, quien asistió a la exposición del Doctor Calcino, comentó que “traer a este tipo de invitados de alto nivel es una excelente oportunidad para nuestros alumnos, porque nos permite la internacionalización, el poder acceder a la ciencia que se está haciendo en otras partes y, también, que quienes nos visitan comprueben que en la Facultad también tenemos un gran desarrollo científico”En tanto, el Doctor Felipe Aguilera, planteó que “el objetivo de esta exposición es que se hiciera una charla más metodológica que de resultados, para que los alumnos de pre y postgrado asistieran y vieran las cosas que ellos son capaces de hacer”. Sobre ello, comentó que “lo que Andrew Calcino expuso suena complejo, pero se puede hacer en un computador convencional y los alumnos podrían aprender a hacer este tipo de análisis en sus respectivas investigaciones, lo que aumentaría mucho el potencial de ellos como estudiantes en el futuro”.
Colaboraciones
El académico del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la FCB, Doctor Felipe Aguilera, impulsó esta iniciativa mediante su proyecto FONDECYT de Iniciación 11180084 y gracias a la vinculación que ha mantenido con el investigador de la Universidad de Viena, desde el año 2011 cuando coincidieron en el programa doctoral que ambos realizaron en la Universidad de Queensland en Australia bajo la supervisión del Profesor Bernard Degnan.“Con Andrew Calcino tenemos en común la pasión por la biología del desarrollo y la evolución, por ello estamos levantando recursos genómicos de organismos poco convencionales, es decir, organismos diferentes a los comúnmente estudiados como Xenopus, Drosophila, C. elegans y ratón; que nos permitan responder preguntas de este ámbito”.
Sobre las colaboraciones que se desarrollarán en esta línea, el académico de la FCB indicó que “queremos investigar el proceso de cómo el zigoto es activado durante el desarrollo para iniciar los eventos celulares y moleculares que ocurren durante el desarrollo de los animales, lo que se conoce como “activación del genoma del zigoto” o Zygotic Genome Activation ”.El Doctor Aguilera explicó que “la transición del zigoto al embrión es un proceso complejo que involucra la inactivación genómica del zigoto y la activación del genoma embrionario.
La acción de los ARNm maternos es clave para que la activación del genoma embrionario se realice a tiempo y en forma adecuada; por lo tanto, entender la participación de estos transcritos en la activación del genoma embrionario es esencial para establecer los procesos celulares y moleculares que participan en el desarrollo embrionario de los animales”.
El trabajo colaborativo que se desarrollará en la UdeC utilizará como modelo al erizo de mar (Tetrapygus niger), equinodermo el cual se tiene su secuencia de ADN completa y que se convirtió en el primer genoma de un invertebrado marino secuenciado en Chile.“Vamos a utilizar el modelo del Dr. Calcino de Dreissena rostriformis, para evaluar el grado de conservación genético-molecular de este proceso en animales marinos utilizando enfoques de genómica y transcriptómica comparativa entre un molusco y un equinodermo”, indicó el docente UdeC Además, agregó que su interés es continuar impulsando este tipo de vinculaciones, “uno de mis objetivos en la UdeC es hacer colaboración internacional con destacados investigadores que conocí mientras realizaba mi doctorado y postdoctorados en el extranjero”, puntualizó.
